Articles

Ochrobactrum anthropi

This student page has not been curated.

A Microbial Biorealm page on the genus Ochrobactrum anthropi

Classification

Photo By Michael Abbey/Science Photo Library

Higher order taxa

Bacteria (Domain); Proteobacteria (Phylum); Alphaproteobacteria (Class); Rhizobiales (Order); Brucellaceae (Family); Ochrobacterium (Genus); Ochrobacterium anthropi (Species)

Species

Ochrobacterium anthropi

NCBI: Taxonomie, genom

popis a význam

o. anthropi, dříve známý jako druh Achromobakterií (skupina CDC Vd), je běžná půdní alfaproteobakterie, která kolonizuje široké spektrum organismů a je stále více uznávána jako potenciálně problematický oportunistický a nozokomiální lidský patogen. Ačkoli je extrémně vzácné, že postihuje zdravého člověka, bylo mnoho publikovaných případů spojených s přítomností zdravotnických prostředků, jako jsou centrální žilní katétry, drenážní trubice a intraperitoneální katétry. Vyznačuje se také širokým spektrem rezistence na antibiotika.

struktura genomu

o. antropi chromozom 1

o. antropi chromozom 2

4, 8 Mb genom o. anthropi se skládá ze dvou neidentických kruhových chromozomů. Genom má průměrný obsah C + G 56,22% a dohromady obsahuje 4 424 genů kódujících proteiny (~87% kódování) spolu s 31 pseudogeny a 73 strukturními RNA (rRna, tRNA a malá RNA). Genom o. antropi také obsahuje čtyři plazmidy. poan01, pOAN02 a pOAN03 mají očekávané vlastnosti alfaproteobakteriálních plazmidů, ale pOAN04 ne – postrádá známé replikační, rozdělovací a konjugační systémy.

o. antropi životní prostředí

struktura a ekologie

o.anthropi je univerzální alphaproteobacterium se schopností kolonizovat mimořádně širokou škálu stanovišť, od nepřátelského prostředí, jako je znečištěná půda, po vodu, rostliny, hlístice, hmyz, zvířata a lidi. Jsou ve tvaru tyče, gramnegativní, a pohyblivý pomocí peritrichous flagella. Po růstu na živném agaru mají kolonie průměr asi 1 µm, nepigmentované, kruhové, nízké konvexní, hladké, zářící a celé. Optimální teplota pro růst je mezi 20 a 37C.

metabolismus

o. antropické organismy jsou povinně aerobní a mají striktně respirační typ metabolismu s O2 jako terminálním akceptorem elektronů. Jsou chemoorganotrofní, používají různé aminokyseliny, organické kyseliny a uhlohydráty jako zdroje uhlíku a jsou pozitivní na oxidázu i katalázu. Také redukují dusičnany i dusitany asimilací.

patologie

bakteriální endokarditida

ačkoli případy o. antropi patogenní jsou vzácné, existuje několik zdokumentovaných případů, které ukazují, že je to možné u jedinců se základním zdravotním stavem. Mezi těmito jedinci jsou nejvíce náchylní lidé s vnitřním zdravotnickým zařízením, jako jsou katétry a drenážní trubice. To je pravděpodobně způsobeno jeho schopností přilnout k různým syntetickým materiálům. Účinky o. antropi, když se zdá, že patogenní se velmi liší v závislosti na hostiteli. Způsobuje bakterémii, která může způsobit sepse, septický šok a může dokonce vést k život ohrožujícím infekcím-jako je infekční endokarditida a osteomyelitida. O. antropi má velmi široké spektrum rezistence na antibiotika (zejména na β-laktamy), což ztěžuje léčbu.

1.Patrick S. G. Chain, Dorothy M. Lang, Diego J. Comerci, Stephanie A.Malfatti, Lisa M. Vergez, Maria Shin, Rodolfo A. Ugalde, Emilio Garcia, Marcello E. Tolmasky. Genom Ochrobactrum antropi ATCC 49288T všestranný oportunistický patogen a Symbiont několika eukaryotických hostitelů. Žurnál Bakteriologie 2011. doi: 10.1128 / JB.05335-11

2.Adrian Kettaneh, Francois-Xavior Weill, Isabelle Poilane, Oliver Fran, Michel Thomas, Jean-Louis Herrmann, Laurent Hocqueloux. Septický šok způsobený Ochrobactrum anthropi u jinak zdravého hostitele. J.Clinton 2003. doi: 10.1128 / JCM.41.3.1339-1341.2003

3.Alnor D, Frimodt-Moller N, Espersen F, Frederiksen W. Infekce neobvyklými lidskými patogeny Agrobacterium Species a Ochrobactrum antropi. Klinické Infekční Nemoci 1994. doi: 10.1093 / klinidy/18.6.914

4.Mahmood MS, Sarwari AR, Khan MA, Sophie Z, Khan E, Sami s. infekční endokarditida a septická embolizace s Ochrobactrum antropi: kazuistika a přehled literatury. Journal of Infection 2000. doi: 10.1053 / jinf.2000.0644

5.Sara Romano, Fabian Aujoulat, Estelle Jumas-Bilak, Anges Masnou, Jean-Luc Jeannot, Envold Falsen, Helene Marchandin, Corinne Teyssier. Multilocus sekvenční typizace podporuje hypotézu, že Ochrobactrum anthropi zobrazuje subpopulaci spojenou s člověkem. BMC mikrobiologie 2009. doi: 10.1186/1471-2180-9-267

6.B.Holmes, M. Popoff, M. Kiredjian, M. Kersters. Ochrobactrum antropi gen. nov., SP. Novum. z lidských klinických vzorků a dříve známých jako skupina Vd. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 2012. doi: 10.1099/00207713-38-4-406

7. Genom Zobrazit Ochrobactrum antropi ATCC 49188 chromozom 1. Gene Trek V Prokaryotním prostoru (GTPS). Datová banka DNA Japonska.

8. Genom Zobrazit Ochrobactrum antropi ATCC 49188 chromozom 2. Gene Trek V Prokaryotním prostoru (GTPS). Datová banka DNA Japonska.

9. Půda. Food drobky blog.

10 endokarditida. Společnost pro kardiovaskulární angiografii a intervence.

editoval Eric Beaver Dr. Lisa R. Moore, University of Southern Maine, Department of Biological Sciences, http://www.usm.maine.edu/bio

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.